Bên cạnh sự tham gia trực tiếp của người chơi trong việc lựa chọn cốt truyện, cách chơi trong Way of the Samurai tập trung chủ yếu vào chiến đấu. Chiến đấu được thực hiện gần như hoàn toàn với thanh kiếm samurai khác nhau có sẵn trong trò chơi. Way of the Samurai có hơn 40 loại thanh kiếm khác nhau, tuy nhiên lúc mới bắt đầu game người chơi chỉ có một thanh kiếm duy nhất. Bằng cách đánh bại kẻ thù, người chơi có thể lượm các loại vũ khí của đối phương cho vào kho riêng của mình. Người chơi chỉ có thể mang tối đa là ba thanh kiếm cùng một lúc. Sau mỗi lượt chơi, người chơi có thể để lại một thanh kiếm bổ sung ở chỗ thợ rèn Dojima, và gửi vào bộ sưu tập kiếm của mình.[2]

Hệ thống chiến đấu

Người chơi thường sẽ lựa chọn có hay không tham gia chiến đấu với một NPC cụ thể, tuy nhiên một khi bị buộc phải tham gia chiến đấu, người chơi có thể buộc phải chiến đấu với nhiều đối thủ cùng một lúc.

Kenji có một bộ các bước di chuyển cơ bản có thể áp dụng cho tất cả vũ khí, bao gồm kỹ năng tấn công thông thường và tấn công mạnh mẽ, đỡ đòn, và đá. Có rất nhiều biến thể và sự kết hợp của những chuyển động cơ bản có sẵn tùy thuộc vào thanh kiếm đặc biệt được trang bị vào lúc đó. Bằng cách đánh bại đối thủ hoặc thu thập vật phẩm đặc biệt Kenji cũng có thể mở khóa các chiêu thức tấn công đặc biệt và sự kết hợp cụ thể cho từng loại vũ khí. Ngoài ra còn có một số tư thế chiến đấu khác nhau, tùy thuộc vào thanh kiếm đặc biệt được trang bị, mỗi loại kiếm trong số đó sẽ tạo thành phong cách chiến đấu riêng biệt, nếu biết cách sử dụng và kết hợp lẫn nhau, người chơi có thể tạo ra một loạt chiêu liên hoàn khác nhau, với mức sát thương khá cao, thích hợp khi giao chiến với trùm hoặc những NPC đáng gờm.

Hệ thống tăng cường kiếm

Mỗi thanh kiếm có sẵn trong trò chơi có một số thuộc tính có thể ảnh hưởng đến hiệu quả của nó trong trận chiến. Những thuộc tính này có thể được tăng cường bằng cách sử dụng các item đặc biệt tìm thấy trong game, hoặc viếng thăm thợ rèn.

• Độ sắc nét (Sharpness): Sức mạnh tấn công, tăng / giảm số lượng sát thương gây ra khi đối thủ giao chiến với kiếm
• Tính linh hoạt (Flexibility): Sức mạnh phòng thủ, tăng / giảm số lượng sát thương chịu đựng khi người chơi bị đối thủ tấn công
• Độ bền (Durability): Sức mạnh của kiếm, làm tăng lượng nhiệt thanh kiếm có thể tạo ra trước khi gãy (nhiệt được tạo ra bằng cách đánh hoặc đỡ đòn, và hiển thị bằng cách sử dụng một đồng hồ trên màn hình)
• Sinh mệnh (Life): Tăng / giảm tổng số điểm hit point cột máu của người chơi.